Ligand name: Guanosine-5'-Diphosphate
PDB ligand accession: GDP
DrugBank: DB04315
PubChem: 8977;5280316;135398619;
ChEMBL: CHEMBL384759
InChI Key: QGWNDRXFNXRZMB-UUOKFMHZSA-N
SMILES: NC1=NC2=C(N=CN2[C@@H]2O[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]2O)C(=O)N1
Drug action: n/a

List of small molecule binding-associated PTMs for P13639

Residue	UniProt number	Type of PTM	AlphaFold3 models	Rosetta models	Chai-1 models
LYS	337	Acetylation	PyMOL_AF3	PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
LYS	32	Acetylation	PyMOL_AF3	PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
LYS	159	Acetylation	PyMOL_AF3	PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
LYS	333	Acetylation	PyMOL_AF3	PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
LYS	337	Malonylation		PyMOL_RFAA
SER	38	Phosphorylation	PyMOL_AF3	PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
THR	54	Phosphorylation	PyMOL_AF3	PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
THR	57	Phosphorylation	PyMOL_AF3	PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
SER	33	Phosphorylation	PyMOL_AF3	PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
THR	34	Phosphorylation	PyMOL_AF3	PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
THR	36	Phosphorylation	PyMOL_AF3	PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
CYS	67	S-nitrosylation	PyMOL_AF3	PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
LYS	159	Ubiquitination
LYS	333	Ubiquitination
LYS	337	Ubiquitination
LYS	445	Acetylation	PyMOL_AF3	PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
LYS	445	Malonylation		PyMOL_RFAA
LYS	445	Methylation	PyMOL_AF3 PyMOL_AF3	PyMOL_RFAA PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1 PyMOL_Chai1 PyMOL_Chai1 PyMOL_Chai1
LYS	525	Methylation	PyMOL_AF3 PyMOL_AF3	PyMOL_RFAA PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1 PyMOL_Chai1 PyMOL_Chai1 PyMOL_Chai1
TYR	443	Phosphorylation	PyMOL_AF3	PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
MET	430	Sulfoxidation		PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
MET	401	Sulfoxidation		PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
LYS	529	Sumoylation
LYS	445	Ubiquitination
LYS	481	Ubiquitination
LYS	525	Ubiquitination
CYS	41	Glutathionylation		PyMOL_RFAA
SER	23	Phosphorylation	PyMOL_AF3	PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
CYS	41	S-nitrosylation	PyMOL_AF3	PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
MET	22	Sulfoxidation		PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
MET	353	Sulfoxidation		PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
LYS	42	Acetylation	PyMOL_AF3	PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
SER	48	Phosphorylation	PyMOL_AF3	PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
THR	59	Phosphorylation	PyMOL_AF3	PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
MET	1	Sulfoxidation		PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
MET	453	Sulfoxidation		PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
MET	454	Sulfoxidation		PyMOL_RFAA	PyMOL_Chai1
LYS	42	Ubiquitination