Ligand name: 4-NITRO-BENZYLPHOSPHONOBUTANOYL-GLYCINE
PDB ligand accession: PNB
DrugBank: DB08409
InChI Key: LNMNPGKCSJFAGN-UHFFFAOYSA-N
SMILES: c1cc(ccc1COP(=O)(CCCC(=O)NCC(=O)O)O)[N+](=O)[O-]
Drug action: n/a

ClassyFire chemical classification:

• Kingdom: Organic compounds
  • Superclass: Organic acids and derivatives
    • Class: Carboxylic acids and derivatives
      • Subclass: Amino acids, peptides, and analogues

List of PDB structures and/or AlphaFold models with target protein P01857

PDB/AF Accession	PyMOL script	Experimental / Predicted	Interacting ECOD domains	ECOD X-group name
P01857	Download	Predicted	P01857_F1_nD2 P01857_F1_nD3	Immunoglobulin-like beta-sandwich Immunoglobulin-like beta-sandwich
1AJ7		Predicted	e1aj7H2
1AQK		Predicted	e1aqkH2 e1aqkH1
1D5B		Predicted	e1d5bB1 e1d5bH1 e1d5bB2 e1d5bH2
1D5I		Predicted	e1d5iH1 e1d5iH2
1D6V		Predicted	e1d6vH1 e1d6vH2
1DFB		Predicted	e1dfbH2
1DN2		Predicted	e1dn2B1 e1dn2A1 e1dn2B2 e1dn2A2
1E4K		Predicted	e1e4kA1 e1e4kB1 e1e4kB2 e1e4kA2
1FC1		Predicted	e1fc1B1 e1fc1A1 e1fc1B2 e1fc1A2
1FC2		Predicted	e1fc2D1 e1fc2D2
1FCC		Predicted	e1fccA1 e1fccB1 e1fccB2 e1fccA2
1GAF		Predicted	e1gafH2
1H3T		Predicted	e1h3tB1 e1h3tA1 e1h3tA2 e1h3tB3
1H3U		Predicted	e1h3uB1 e1h3uA1 e1h3uA2 e1h3uB2
1H3V		Predicted	e1h3vB1 e1h3vA1 e1h3vB2 e1h3vA2
1H3W		Predicted	e1h3wM1 e1h3wM2
1H3X		Predicted	e1h3xB1 e1h3xA1 e1h3xB2 e1h3xA2
1H3Y		Predicted	e1h3yB1 e1h3yA1 e1h3yB2 e1h3yA2
1HKL		Predicted	e1hklH2
1HZH		Predicted	e1hzhK3 e1hzhH7 e1hzhK4 e1hzhH8 e1hzhK2 e1hzhH6
1I7Z		Predicted	e1i7zD2 e1i7zB2
1L6X		Predicted	e1l6xA1 e1l6xA2
1OQO		Predicted	e1oqoB1 e1oqoA1 e1oqoB2 e1oqoA2
1OQX		Predicted	e1oqxA1 e1oqxB1 e1oqxA2 e1oqxB2
1T83		Predicted	e1t83A1 e1t83B1 e1t83A2 e1t83B2
1T89		Predicted	e1t89A1 e1t89B1 e1t89B2 e1t89A2
2DTS		Predicted	e2dtsB1 e2dtsA1 e2dtsB2 e2dtsA2
2GJ7		Predicted	e2gj7B1 e2gj7A1 e2gj7A2 e2gj7B2
2IWG		Predicted	e2iwgD1 e2iwgA1 e2iwgA2 e2iwgD2
2J6E		Predicted	e2j6eA1 e2j6eB3 e2j6eA2 e2j6eB4
2QL1		Predicted	e2ql1A1 e2ql1A2
2RCS		Predicted	e2rcsH2
2WAH		Predicted	e2wahA1 e2wahB1 e2wahA2 e2wahB2
3AVE		Predicted	e3aveA1 e3aveB1 e3aveA2 e3aveB2
3AY4		Predicted	e3ay4A1 e3ay4B1 e3ay4A2 e3ay4B2
3C2S		Predicted	e3c2sA1 e3c2sA2
3D6G		Predicted	e3d6gA1 e3d6gB1 e3d6gA2 e3d6gB2
3DJ9		Predicted	e3dj9A1
3DNK		Predicted	e3dnkA1 e3dnkB1 e3dnkA2 e3dnkB2
3DO3		Predicted	e3do3A1 e3do3B1 e3do3A2 e3do3B2
3FJT		Predicted	e3fjtA1 e3fjtB1 e3fjtA2 e3fjtB2
3MCL		Predicted	e3mclH2
3O11		Predicted	e3o11H2 e3o11B2
3RY6		Predicted	e3ry6A1 e3ry6B1 e3ry6A2 e3ry6B2
3S7G		Predicted	e3s7gC1 e3s7gD1 e3s7gB1 e3s7gA2 e3s7gC3 e3s7gD3 e3s7gB3 e3s7gA3
3SGJ		Predicted	e3sgjA1 e3sgjB1 e3sgjA2 e3sgjB2
3SGK		Predicted	e3sgkB1 e3sgkA1 e3sgkA2 e3sgkB2
3TYG		Predicted	e3tygH2
3V7M		Predicted	e3v7mA1 e3v7mA2
3V8C		Predicted	e3v8cB1 e3v8cA1 e3v8cB3 e3v8cA3
3V95		Predicted	e3v95A1 e3v95B1 e3v95A3 e3v95B3
3WJJ		Predicted	e3wjjA1 e3wjjB2 e3wjjA2 e3wjjB3
3WJL		Predicted	e3wjlA1 e3wjlB2 e3wjlA2 e3wjlB3
3WKN		Predicted	e3wknB2 e3wknN2 e3wknC2 e3wknA2 e3wknD2 e3wknI2 e3wknJ2 e3wknM2 e3wknB1 e3wknN1 e3wknC1 e3wknA1 e3wknD1 e3wknI1 e3wknJ1 e3wknM1
3WN5		Predicted	e3wn5A1 e3wn5D1 e3wn5B2 e3wn5E2 e3wn5A2 e3wn5D2 e3wn5B1 e3wn5E1
4ACP		Predicted	e4acpB1 e4acpA1 e4acpA2 e4acpB3
4B7I		Predicted	e4b7iA1 e4b7iB1 e4b7iA2 e4b7iB3
4BM7		Predicted	e4bm7A1 e4bm7B3 e4bm7A2 e4bm7B4
4BSV		Predicted	e4bsvA1 e4bsvB1 e4bsvA2 e4bsvB2
4BSW		Predicted	e4bswA1 e4bswB1 e4bswA2 e4bswB2
4BYH		Predicted	e4byhA1 e4byhB1 e4byhA2 e4byhB2
4CDH		Predicted	e4cdhB2 e4cdhA1 e4cdhB1 e4cdhA2
4DZ8		Predicted	e4dz8A1 e4dz8B1 e4dz8B3 e4dz8A2
4EOW		Predicted	e4eowH2
4J12		Predicted	e4j12A1 e4j12A2
4KU1		Predicted	e4ku1B1 e4ku1A1 e4ku1B2 e4ku1A2
4LLD		Predicted	e4lldA1
4LLM		Predicted	e4llmA1
4LLQ		Predicted	e4llqA1
4N0U		Predicted	e4n0uE2 e4n0uE1
4NQS		Predicted	e4nqsA2 e4nqsG1 e4nqsB1 e4nqsH1 e4nqsA1 e4nqsG2 e4nqsB2 e4nqsH2
4NQT		Predicted	e4nqtA1 e4nqtA2
4NQU		Predicted	e4nquA2 e4nquA1
4NWU		Predicted	e4nwuH2
4Q6Y		Predicted	e4q6yA2 e4q6yB2 e4q6yC2 e4q6yD1 e4q6yA1 e4q6yB1 e4q6yC1 e4q6yD2
4Q74		Predicted	e4q74B1 e4q74A1 e4q74B2 e4q74A2
4Q7D		Predicted	e4q7dA2 e4q7dB2 e4q7dA1 e4q7dB1
4W4N		Predicted	e4w4nA1 e4w4nB1 e4w4nA2 e4w4nB2
4W4O		Predicted	e4w4oB2 e4w4oA1 e4w4oB1 e4w4oA2
4WI2		Predicted	e4wi2A2 e4wi2B2 e4wi2A1 e4wi2B1
4WI3		Predicted	e4wi3A2 e4wi3B1 e4wi3A1 e4wi3B2
4WI4		Predicted	e4wi4B2 e4wi4A2 e4wi4B1 e4wi4A1
4WI5		Predicted	e4wi5A1 e4wi5B1 e4wi5A2 e4wi5B2
4WI6		Predicted	e4wi6A1 e4wi6B2 e4wi6A2 e4wi6B1
4WI7		Predicted	e4wi7A1 e4wi7B1 e4wi7A2 e4wi7B2
4WI8		Predicted	e4wi8A1 e4wi8B2 e4wi8A2 e4wi8B1
4WI9		Predicted	e4wi9A2 e4wi9B2 e4wi9A1 e4wi9B1
4X4M		Predicted	e4x4mA1 e4x4mB1 e4x4mC1 e4x4mD2 e4x4mA2 e4x4mB2 e4x4mC2 e4x4mD1
4X98		Predicted	e4x98B2 e4x98A2 e4x98B1 e4x98A1
4X99		Predicted	e4x99B2 e4x99A1 e4x99B1 e4x99A2
4ZNE		Predicted	e4zneJ1 e4zneE1 e4zneJ2 e4zneE2
5BW7		Predicted	e5bw7A1 e5bw7B1 e5bw7A2 e5bw7B2
5D4Q		Predicted	e5d4qA1 e5d4qB2 e5d4qA2 e5d4qB1
5D6D		Predicted	e5d6dA1 e5d6dB1 e5d6dA2 e5d6dB2
5DI8		Predicted	e5di8B2 e5di8A2 e5di8B1 e5di8A1
5DJ0		Predicted	e5dj0B1 e5dj0A1 e5dj0A2 e5dj0B2
5DJ2		Predicted	e5dj2A2 e5dj2B2 e5dj2A1 e5dj2B1
5DJ6		Predicted	e5dj6A1 e5dj6B1 e5dj6A2 e5dj6B2
5DJ8		Predicted	e5dj8B1 e5dj8A1 e5dj8A2 e5dj8B2
5DJA		Predicted	e5djaB1 e5djaA2 e5djaA1 e5djaB2
5DJC		Predicted	e5djcB1 e5djcE1 e5djcA2 e5djcD1 e5djcB2 e5djcE2 e5djcA1 e5djcD2
5DJD		Predicted	e5djdA1 e5djdB1 e5djdA2 e5djdB2
5DJX		Predicted	e5djxB2 e5djxE1 e5djxA2 e5djxD2 e5djxA1 e5djxD1 e5djxB1 e5djxE2
5DJY		Predicted	e5djyA1 e5djyB1 e5djyA2 e5djyB2
5DJZ		Predicted	e5djzA2 e5djzA1 e5djzB1
5DK0		Predicted	e5dk0A1 e5dk0B1 e5dk0A2 e5dk0B2
5DK2		Predicted	e5dk2E1 e5dk2A1 e5dk2B2 e5dk2E2 e5dk2A2 e5dk2B1
5DVK		Predicted	e5dvkA2 e5dvkA1
5DVL		Predicted	e5dvlA2 e5dvlA1
5DVM		Predicted	e5dvmA1 e5dvmA2
5DVN		Predicted	e5dvnA2 e5dvnA1
5DVO		Predicted	e5dvoA2 e5dvoB2 e5dvoA1 e5dvoB1
5GSQ		Predicted	e5gsqA1 e5gsqB1 e5gsqC1 e5gsqD2 e5gsqA2 e5gsqB2 e5gsqC2 e5gsqD1
5HSF		Predicted	e5hsfA1 e5hsfB1
5HY9		Predicted	e5hy9A2 e5hy9B1 e5hy9A1 e5hy9B2
5HYE		Predicted	e5hyeC2 e5hyeA2 e5hyeC1 e5hyeA1
5HYF		Predicted	e5hyfA2 e5hyfA1
5HYI		Predicted	e5hyiA1 e5hyiB1 e5hyiD1 e5hyiC1 e5hyiA2 e5hyiB2 e5hyiD2 e5hyiC2
5IW3		Predicted	e5iw3A1 e5iw3A2
5IW6		Predicted	e5iw6A1 e5iw6B1 e5iw6A2 e5iw6B2
5JIH		Predicted	e5jihA1 e5jihB1 e5jihA2 e5jihB2
5JII		Predicted	e5jiiB2 e5jiiA2 e5jiiB1 e5jiiA1
5JIK		Predicted	e5jikA1 e5jikB1 e5jikA2 e5jikB2
5K33		Predicted	e5k33A1 e5k33A2
5KWG		Predicted	e5kwgA1 e5kwgA2
5M3V		Predicted	e5m3vB2 e5m3vB1 e5m3vA2 e5m3vA1
5TPS		Predicted	e5tpsA2 e5tpsB2 e5tpsA1 e5tpsB1
5U4Y		Predicted	e5u4yA2 e5u4yB2 e5u4yA1 e5u4yB1
5U52		Predicted	e5u52B1 e5u52A1 e5u52B2 e5u52A2
5U66		Predicted	e5u66A2 e5u66A1
5V43		Predicted	e5v43A1 e5v43B1 e5v43A2 e5v43B2
5V4E		Predicted	e5v4eE1 e5v4eA2 e5v4eG1 e5v4eH2 e5v4eF2 e5v4eD1 e5v4eB1 e5v4eC2 e5v4eE2 e5v4eA1 e5v4eG2 e5v4eH1 e5v4eF1 e5v4eD2 e5v4eB2 e5v4eC1
6DCV		Predicted	e6dcvH1 e6dcvB2
6DCW		Predicted	e6dcwH2
6DE7		Predicted	e6de7H2 e6de7D2
6F2Z		Predicted	e6f2zB1 e6f2zA1 e6f2zB2 e6f2zA2