PDB ligand accession: NDP
DrugBank: DB02338
PubChem: 5884;134821689;
ChEMBL:
InChI Key: ACFIXJIJDZMPPO-NNYOXOHSSA-N
SMILES: c1nc(c2c(n1)n(cn2)C3C(C(C(O3)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC4C(C(C(O4)N5C=CCC(=C5)C(=O)N)O)O)O)OP(=O)(O)O)N
Drug action: n/a
ClassyFire chemical classification:
- Kingdom: Organic compounds
- Superclass: Nucleosides, nucleotides, and analogues
- Class: (5'->5')-dinucleotides
- Subclass: None
- Class: (5'->5')-dinucleotides
- Superclass: Nucleosides, nucleotides, and analogues
PDB/AF Accession | PyMOL script | Experimental / Predicted | Interacting ECOD domains | ECOD X-group name | LigPlot |
---|---|---|---|---|---|
1JN0 | Download | Experimental | e1jn0O1 e1jn0O2 e1jn0B1 e1jn0A1 e1jn0A2 e1jn0B1 e1jn0A1 e1jn0A2 e1jn0B2 | FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like FwdE/GAPDH domain-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like FwdE/GAPDH domain-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like Rossmann-like | LigPlot |
1RM3 | Download | Experimental | e1rm3O1 e1rm3O2 e1rm3A1 e1rm3B1 e1rm3A2 e1rm3A1 e1rm3B1 e1rm3A2 e1rm3B2 | FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like FwdE/GAPDH domain-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like FwdE/GAPDH domain-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like Rossmann-like | LigPlot |
1RM4 | Download | Experimental | e1rm4O1 e1rm4O2 e1rm4B1 e1rm4A1 e1rm4A2 e1rm4B1 e1rm4A1 e1rm4B2 e1rm4A2 | FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like FwdE/GAPDH domain-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like FwdE/GAPDH domain-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like Rossmann-like | LigPlot |
2PKQ | Download | Experimental | e2pkqO2 e2pkqR1 e2pkqO1 e2pkqR2 e2pkqP1 e2pkqQ1 e2pkqP2 e2pkqP1 e2pkqQ1 e2pkqP2 e2pkqQ2 e2pkqS1 e2pkqS2 | Rossmann-like FwdE/GAPDH domain-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like FwdE/GAPDH domain-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like FwdE/GAPDH domain-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like Rossmann-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like | LigPlot |
2PKR | Download | Experimental | e2pkrO1 e2pkrR1 e2pkrR2 e2pkrO2 e2pkrO1 e2pkrR1 e2pkrR2 e2pkrP1 e2pkrQ1 e2pkrP2 e2pkrP1 e2pkrQ1 e2pkrQ2 e2pkrP2 e2pkrB1 e2pkrA1 e2pkrA2 e2pkrB1 e2pkrA1 e2pkrB2 e2pkrA2 e2pkrC1 e2pkrD1 e2pkrC2 e2pkrC1 e2pkrD1 e2pkrD2 e2pkrH1 e2pkrI1 e2pkrH2 e2pkrH1 e2pkrI1 e2pkrI2 e2pkrM1 e2pkrL1 e2pkrL2 e2pkrM1 e2pkrL1 e2pkrM2 e2pkrL2 | FwdE/GAPDH domain-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like Rossmann-like FwdE/GAPDH domain-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like FwdE/GAPDH domain-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like FwdE/GAPDH domain-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like Rossmann-like FwdE/GAPDH domain-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like FwdE/GAPDH domain-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like Rossmann-like FwdE/GAPDH domain-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like FwdE/GAPDH domain-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like FwdE/GAPDH domain-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like FwdE/GAPDH domain-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like FwdE/GAPDH domain-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like FwdE/GAPDH domain-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like Rossmann-like | LigPlot |
1RM5 | Download | Experimental | e1rm5O1 e1rm5O2 e1rm5A1 e1rm5B1 e1rm5A2 e1rm5A1 e1rm5B1 e1rm5A2 e1rm5B2 | FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like FwdE/GAPDH domain-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like FwdE/GAPDH domain-like FwdE/GAPDH domain-like Rossmann-like Rossmann-like | LigPlot |