Ligand name: Variolin B
PDB ligand accession: VAR
DrugBank: DB08694
InChI Key: RTHKPHCVZVYDFN-UHFFFAOYSA-N
SMILES: c1cnc(n2c1c(c3c2nccc3O)c4ccnc(n4)N)N
Drug action: n/a

ClassyFire chemical classification:

• Kingdom: Organic compounds
  • Superclass: Organoheterocyclic compounds
    • Class: Pyrrolopyridines
      • Subclass: None

List of PDB structures and/or AlphaFold models with target protein P20248

PDB/AF Accession	PyMOL script	Experimental / Predicted	Interacting ECOD domains	ECOD X-group name
P20248	Download	Predicted	P20248_F1_nD1 P20248_F1_nD2	HTH HTH
1E9H		Predicted	e1e9hD2 e1e9hB2 e1e9hB1 e1e9hD1
1FIN		Predicted	e1finB2 e1finD2 e1finD1 e1finB1
1FVV		Predicted	e1fvvD2 e1fvvB2 e1fvvD1 e1fvvB1
1GY3		Predicted	e1gy3D2 e1gy3B2 e1gy3D1 e1gy3B1
1H1P		Predicted	e1h1pD2 e1h1pB2 e1h1pD1 e1h1pB1
1H1Q		Predicted	e1h1qD2 e1h1qB2 e1h1qB1 e1h1qD1
1H1R		Predicted	e1h1rD2 e1h1rB2 e1h1rB1 e1h1rD1
1H1S		Predicted	e1h1sB2 e1h1sD2 e1h1sB1 e1h1sD1
1H24		Predicted	e1h24D2 e1h24B2 e1h24B1 e1h24D1
1H25		Predicted	e1h25B2 e1h25D2 e1h25D1 e1h25B1
1H26		Predicted	e1h26B2 e1h26D2 e1h26D1 e1h26B1
1H27		Predicted	e1h27D2 e1h27B2 e1h27B1 e1h27D1
1H28		Predicted	e1h28B2 e1h28D2 e1h28D1 e1h28B1
1JST		Predicted	e1jstD2 e1jstB2 e1jstD1 e1jstB1
1JSU		Predicted	e1jsuB2 e1jsuB1
1OGU		Predicted	e1oguB2 e1oguD2 e1oguB1 e1oguD1
1OI9		Predicted	e1oi9B2 e1oi9D2 e1oi9D1 e1oi9B1
1OIU		Predicted	e1oiuD2 e1oiuB2 e1oiuB1 e1oiuD1
1OIY		Predicted	e1oiyD2 e1oiyB2 e1oiyD1 e1oiyB1
1OKV		Predicted	e1okvB2 e1okvD2 e1okvD1 e1okvB1
1OKW		Predicted	e1okwD2 e1okwB2 e1okwD1 e1okwB1
1OL1		Predicted	e1ol1B2 e1ol1D2 e1ol1D1 e1ol1B1
1OL2		Predicted	e1ol2D2 e1ol2B2 e1ol2B1 e1ol2D1
1P5E		Predicted	e1p5eD2 e1p5eB2 e1p5eD1 e1p5eB1
1PKD		Predicted	e1pkdB2 e1pkdD2 e1pkdB1 e1pkdD1
1QMZ		Predicted	e1qmzD2 e1qmzB2 e1qmzB1 e1qmzD1
1URC		Predicted	e1urcB2 e1urcD2 e1urcB1 e1urcD1
1VYW		Predicted	e1vywB2 e1vywD2 e1vywD1 e1vywB1
2BKZ		Predicted	e2bkzB2 e2bkzD2 e2bkzB1 e2bkzD1
2BPM		Predicted	e2bpmB2 e2bpmD2 e2bpmD1 e2bpmB1
2C4G		Predicted	e2c4gD2 e2c4gB2 e2c4gD1 e2c4gB1
2C5N		Predicted	e2c5nD2 e2c5nB2 e2c5nD1 e2c5nB1
2C5O		Predicted	e2c5oB2 e2c5oD2 e2c5oB1 e2c5oD1
2C5V		Predicted	e2c5vD2 e2c5vB2 e2c5vB1 e2c5vD1
2C5X		Predicted	e2c5xB2 e2c5xD2 e2c5xD1 e2c5xB1
2C6T		Predicted	e2c6tD2 e2c6tB2 e2c6tD1 e2c6tB1
2CCH		Predicted	e2cchB2 e2cchD2 e2cchB1 e2cchD1
2CCI		Predicted	e2cciD2 e2cciB2 e2cciD1 e2cciB1
2CJM		Predicted	e2cjmB2 e2cjmD2 e2cjmB1 e2cjmD1
2I40		Predicted	e2i40D2 e2i40B2 e2i40B1 e2i40D1
2IW6		Predicted	e2iw6D2 e2iw6B2 e2iw6B1 e2iw6D1
2IW8		Predicted	e2iw8B2 e2iw8D2 e2iw8B1 e2iw8D1
2IW9		Predicted	e2iw9B2 e2iw9D2 e2iw9B1 e2iw9D1
2UUE		Predicted	e2uueB2 e2uueD2 e2uueB1 e2uueD1
2UZB		Predicted	e2uzbB2 e2uzbD2 e2uzbB1 e2uzbD1
2UZD		Predicted	e2uzdD2 e2uzdB2 e2uzdD1 e2uzdB1
2UZE		Predicted	e2uzeD2 e2uzeB2 e2uzeD1 e2uzeB1
2UZL		Predicted	e2uzlB2 e2uzlD2 e2uzlB1 e2uzlD1
2V22		Predicted	e2v22D2 e2v22B2 e2v22D1 e2v22B1
2WEV		Predicted	e2wevB2 e2wevD2 e2wevB1 e2wevD1
2WFY		Predicted	e2wfyB2 e2wfyD2 e2wfyB1 e2wfyD1
2WHB		Predicted	e2whbB2 e2whbD2 e2whbB1 e2whbD1
2WIH		Predicted	e2wihB2 e2wihD2 e2wihB1 e2wihD1
2WIP		Predicted	e2wipB2 e2wipD2 e2wipB1 e2wipD1
2WMA		Predicted	e2wmaB2 e2wmaD2 e2wmaB1 e2wmaD1
2WMB		Predicted	e2wmbB2 e2wmbD2 e2wmbB1 e2wmbD1
2WPA		Predicted	e2wpaB2 e2wpaD2 e2wpaB1 e2wpaD1
2WXV		Predicted	e2wxvB2 e2wxvD2 e2wxvB1 e2wxvD1
2X1N		Predicted	e2x1nB2 e2x1nD2 e2x1nB1 e2x1nD1
3EID		Predicted	e3eidB2 e3eidD2 e3eidB1 e3eidD1
3EJ1		Predicted	e3ej1B2 e3ej1D2 e3ej1D1 e3ej1B1
3EOC		Predicted	e3eocB2 e3eocD2 e3eocB1 e3eocD1
3F5X		Predicted	e3f5xB2 e3f5xD2 e3f5xB1 e3f5xD1
4BCK		Predicted	e4bckB2 e4bckD2 e4bckB1 e4bckD1
4BCM		Predicted	e4bcmD2 e4bcmB2 e4bcmD1 e4bcmB1
4BCN		Predicted	e4bcnD2 e4bcnB2 e4bcnD1 e4bcnB1
4BCP		Predicted	e4bcpB2 e4bcpD2 e4bcpB1 e4bcpD1
4CFM		Predicted	e4cfmB1 e4cfmD1 e4cfmB2 e4cfmD2
4CFN		Predicted	e4cfnD2 e4cfnB2 e4cfnD1 e4cfnB1
4CFU		Predicted	e4cfuB2 e4cfuD2 e4cfuB1 e4cfuD1
4CFV		Predicted	e4cfvB2 e4cfvD2 e4cfvB1 e4cfvD1
4CFW		Predicted	e4cfwB2 e4cfwD2 e4cfwB1 e4cfwD1
4CFX		Predicted	e4cfxB1 e4cfxD1 e4cfxB2 e4cfxD2
4EOI		Predicted	e4eoiB2 e4eoiD2 e4eoiB1 e4eoiD1
4EOJ		Predicted	e4eojB2 e4eojD2 e4eojB1 e4eojD1
4EOK		Predicted	e4eokD2 e4eokB2 e4eokD1 e4eokB1
4EOL		Predicted	e4eolD2 e4eolB2 e4eolD1 e4eolB1
4EOM		Predicted	e4eomB2 e4eomD2 e4eomB1 e4eomD1
4EON		Predicted	e4eonD2 e4eonB2 e4eonD1 e4eonB1
4EOO		Predicted	e4eooB2 e4eooD2 e4eooB1 e4eooD1
4EOP		Predicted	e4eopB2 e4eopD2 e4eopB1 e4eopD1
4EOQ		Predicted	e4eoqD2 e4eoqB2 e4eoqD1 e4eoqB1
4EOR		Predicted	e4eorD2 e4eorB2 e4eorD1 e4eorB1
4EOS		Predicted	e4eosB2 e4eosD2 e4eosB1 e4eosD1
4FX3		Predicted	e4fx3D2 e4fx3B2 e4fx3D1 e4fx3B1
5CYI		Predicted	e5cyiB2 e5cyiD2 e5cyiB1 e5cyiD1
5IF1		Predicted	e5if1B2 e5if1D1 e5if1B1 e5if1D2
5LMK		Predicted	e5lmkB1 e5lmkD2 e5lmkB2 e5lmkD1
5NEV		Predicted	e5nevB1 e5nevD2 e5nevB2 e5nevD1
6ATH		Predicted	e6athB2 e6athB1
6GVA		Predicted	e6gvaB2 e6gvaB1
6P3W		Predicted	e6p3wB1 e6p3wD2 e6p3wB2 e6p3wD1