Attributes
UniProt ID
Protein Name
Light-harvesting protein B-870 alpha chain
Ligand Name
Trans-Geranyl BACTERIOCHLOROPHYLL A
DrugBank ID
None
PDB Ligand Accession
ChEMBL ID
n/a
PubChem ID
n/a
InChIKey
ZBSZXIUSELHDGQ-POZHEDQMSA-M
SMILES
CCc1c(c2n3c1C=C4C(=C5C(=O)C(C6=C7C(=C(C8=CC9=[N]([Mg]3(N87)[N]4=C65)C(=C2)C(=C9C)C(=O)C)C)CCC(=O)OCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)C)C(=O)OC)C)C
Drug Action
No data available
Affinity Metrics
No affinity data available
3D Structure
Interactive Mol* view for the current protein-molecule pair.
Structure: 7EQD
Hover over the Mol* viewer to rotate or zoom with the mouse. Move the cursor out of the viewer to go back to normal page scrolling and one-click navigation.
Hover inside the viewer to rotate or zoom. Move out to scroll the page or click links normally.
Color Legend
Unassigned regionsLigand / hetero atomse7eqd01e7eqd11e7eqd21e7eqd31e7eqd41e7eqd51e7eqd61e7eqd71e7eqd81e7eqd91e7eqdA1e7eqdB1e7eqdD1e7eqdE1e7eqdF1e7eqdG1e7eqdH1e7eqdH2e7eqdI1e7eqdJ1e7eqdK1e7eqdL1e7eqdM1e7eqdN1e7eqdO1e7eqdP1e7eqdQ1e7eqdR1e7eqdS1e7eqdT1e7eqdU1e7eqdV1e7eqdW1e7eqdX1e7eqdY1e7eqdZ1
ECOD domains from experimental PDB structures interacting with ligand 07D
| UniProt | DrugBank | PDB Ligand | PDB ID | ECOD Domain | Range Definition |
|---|---|---|---|---|---|
| P02947 | n/a | 07D | 7eqd | e7eqd11 | 1:1-47 |
| P02947 | n/a | 07D | 7eqd | e7eqd31 | 3:1-47 |
| P02947 | n/a | 07D | 7eqd | e7eqd51 | 5:1-47 |
| P02947 | n/a | 07D | 7eqd | e7eqd71 | 7:1-47 |
| P02947 | n/a | 07D | 7eqd | e7eqd91 | 9:1-47 |
| P02947 | n/a | 07D | 7eqd | e7eqdA1 | A:1-47 |
| P02947 | n/a | 07D | 7eqd | e7eqdD1 | D:1-47 |
| P02947 | n/a | 07D | 7eqd | e7eqdF1 | F:1-47 |
| P02947 | n/a | 07D | 7eqd | e7eqdI1 | I:1-47 |
| P02947 | n/a | 07D | 7eqd | e7eqdK1 | K:1-47 |
| P02947 | n/a | 07D | 7eqd | e7eqdO1 | O:1-47 |
| P02947 | n/a | 07D | 7eqd | e7eqdQ1 | Q:1-47 |
| P02947 | n/a | 07D | 7eqd | e7eqdS1 | S:1-47 |
| P02947 | n/a | 07D | 7eqd | e7eqdU1 | U:1-47 |
| P02947 | n/a | 07D | 7eqd | e7eqdW1 | W:1-47 |
| P02947 | n/a | 07D | 7eqd | e7eqdY1 | Y:1-47 |