DrugDomain

Attributes

UniProt ID

Q8RQE8

Protein Name

DNA-directed RNA polymerase subunit beta'

Ligand Name

ZINC ION

DrugBank ID

None

PDB Ligand Accession

ChEMBL ID

n/a

PubChem ID

n/a

InChIKey

PTFCDOFLOPIGGS-UHFFFAOYSA-N

SMILES

[Zn+2]

Drug Action

No data available

Affinity Metrics

No affinity data available

3D Structure

Interactive Mol* view for the current protein-molecule pair.

Mol*

Structure: 1SMY

Open File

Select PDB Structure

Hover over the Mol* viewer to rotate or zoom with the mouse. Move the cursor out of the viewer to go back to normal page scrolling and one-click navigation.

Hover inside the viewer to rotate or zoom. Move out to scroll the page or click links normally.

Color Legend

Unassigned regionsLigand / hetero atomse1smyA1e1smyA2e1smyB1e1smyB2e1smyC2e1smyC4e1smyC5e1smyC6e1smyC7e1smyC8e1smyC9e1smyD1e1smyD10e1smyD2e1smyD3e1smyD4e1smyD5e1smyD6e1smyD7e1smyD8e1smyD9e1smyE1e1smyF1e1smyF2e1smyF3e1smyK1e1smyK2e1smyL1e1smyL2e1smyM2e1smyM4e1smyM5e1smyM6e1smyM7e1smyM8e1smyM9e1smyN1e1smyN10e1smyN2e1smyN3e1smyN4e1smyN5e1smyN6e1smyN7e1smyN8e1smyN9e1smyO1e1smyP1e1smyP2e1smyP3

ECOD domains from experimental PDB structures interacting with ligand ZN

UniProt	DrugBank	PDB Ligand	PDB ID	ECOD Domain	Range Definition
Q8RQE8	n/a	ZN	1smy	e1smyD10	D:1201-1269,D:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	1smy	e1smyD4	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	1smy	e1smyN3	N:1201-1269,N:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	1smy	e1smyN7	N:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	1zyr	e1zyrD4	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	1zyr	e1zyrD8	D:1201-1269,D:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	1zyr	e1zyrN1	N:1201-1269,N:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	1zyr	e1zyrN6	N:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	2a68	e2a68D2	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	2a68	e2a68D4	D:1201-1269,D:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	2a68	e2a68N2	N:1201-1269,N:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	2a68	e2a68N8	N:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	2a69	e2a69D8	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	2a69	e2a69D9	D:1201-1269,D:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	2a69	e2a69N6	N:1201-1269,N:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	2a69	e2a69N7	N:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	2a6e	e2a6eD10	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	2a6e	e2a6eD3	D:1201-1269,D:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	2a6e	e2a6eN3	N:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	2a6e	e2a6eN9	N:1201-1269,N:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	2a6h	e2a6hD4	D:1201-1269,D:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	2a6h	e2a6hD7	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	2a6h	e2a6hN8	N:1201-1269,N:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	2a6h	e2a6hN9	N:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	2be5	e2be5D2	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	2be5	e2be5D3	D:1201-1269,D:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	2be5	e2be5N1	N:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	2be5	e2be5N10	N:1201-1269,N:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	2cw0	e2cw0D10	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	2cw0	e2cw0D2	D:1201-1269,D:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	2cw0	e2cw0N5	N:1201-1269,N:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	2cw0	e2cw0N9	N:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	2o5i	e2o5iD8	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	2o5i	e2o5iD9	D:1201-1269,D:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	2o5i	e2o5iN3	N:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	2o5i	e2o5iN8	N:1201-1269,N:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	2o5j	e2o5jD15	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	2o5j	e2o5jD5	D:1201-1271,D:1329-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	2o5j	e2o5jN17	N:1201-1271,N:1329-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	2o5j	e2o5jN21	N:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	2ppb	e2ppbD4	D:1201-1269,D:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	2ppb	e2ppbD8	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	2ppb	e2ppbN40	N:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	2ppb	e2ppbN42	N:1201-1251,N:1313-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	3aoh	e3aohD4	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	3aoh	e3aohD7	D:1201-1269,D:1331-1499
Q8RQE8	n/a	ZN	3aoh	e3aohI15	I:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	3aoh	e3aohI17	I:1201-1251,I:1313-1501
Q8RQE8	n/a	ZN	3aoh	e3aohN3	N:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	3aoh	e3aohN7	N:1201-1269,N:1331-1502
Q8RQE8	n/a	ZN	3aoi	e3aoiD2	D:1201-1269,D:1331-1499
Q8RQE8	n/a	ZN	3aoi	e3aoiD7	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	3aoi	e3aoiI10	I:1201-1269,I:1331-1499
Q8RQE8	n/a	ZN	3aoi	e3aoiI9	I:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	3aoi	e3aoiN2	N:1201-1269,N:1331-1499
Q8RQE8	n/a	ZN	3aoi	e3aoiN5	N:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	3dxj	e3dxjD11	D:1201-1269,D:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	3dxj	e3dxjD12	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	3dxj	e3dxjN12	N:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	3dxj	e3dxjN4	N:949-1109
Q8RQE8	n/a	ZN	3dxj	e3dxjN9	N:1201-1269,N:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	3eql	e3eqlD1	D:1201-1269,D:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	3eql	e3eqlD3	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	3eql	e3eqlN39	N:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	3eql	e3eqlN41	N:1201-1251,N:1313-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	3wod	e3wodD10	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	3wod	e3wodD11	D:1201-1269,D:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	4g7h	e4g7hD20	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	4g7h	e4g7hN5	N:3-165,N:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	4g7o	e4g7oD5	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	4g7o	e4g7oN9	N:3-165,N:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	4g7z	e4g7zD5	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	4g7z	e4g7zN5	N:3-165,N:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	4gzy	e4gzyD1	D:1201-1269,D:1331-1499
Q8RQE8	n/a	ZN	4gzy	e4gzyD5	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	4gzz	e4gzzD1	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	4gzz	e4gzzD4	D:1201-1269,D:1331-1499
Q8RQE8	n/a	ZN	4mq9	e4mq9D10	D:1201-1269,D:1331-1499
Q8RQE8	n/a	ZN	4mq9	e4mq9D8	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	4oin	e4oinD1	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	4oio	e4oioD4	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	4oip	e4oipD12	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	4oiq	e4oiqD3	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	4oir	e4oirD12	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	4q4z	e4q4zD7	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	4q5s	e4q5sD11	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	4q5s	e4q5sD3	D:1201-1269,D:1331-1502
Q8RQE8	n/a	ZN	4wqs	e4wqsD5	D:1201-1247,D:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	4wqs	e4wqsD7	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	4wqs	e4wqsN6	N:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	4wqs	e4wqsN7	N:1201-1251,N:1313-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	4wqs	e4wqsN9	N:949-1037,N:1058-1109
Q8RQE8	n/a	ZN	4wqt	e4wqtD10	D:949-1109
Q8RQE8	n/a	ZN	4wqt	e4wqtD3	D:1201-1269,D:1331-1499
Q8RQE8	n/a	ZN	4wqt	e4wqtD7	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	4wqt	e4wqtI1	I:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	4wqt	e4wqtI9	I:1201-1269,I:1331-1499
Q8RQE8	n/a	ZN	4wqt	e4wqtN2	N:1201-1269,N:1331-1499
Q8RQE8	n/a	ZN	4wqt	e4wqtN8	N:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	5d4c	e5d4cD11	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	5d4c	e5d4cN2	N:3-165,N:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	5d4d	e5d4dD8	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	5d4d	e5d4dN10	N:3-165,N:448-621
Q8RQE8	n/a	ZN	5d4e	e5d4eD4	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	5d4e	e5d4eN11	N:3-165,N:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	5e17	e5e17D3	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	5e18	e5e18D10	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	5i2d	e5i2dD10	D:3-165,D:449-610
Q8RQE8	n/a	ZN	5i2d	e5i2dO9	O:3-165,O:449-610
Q8RQE8	n/a	ZN	5tmc	e5tmcD1	D:1201-1269,D:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	5tmc	e5tmcD11	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	5vo8	e5vo8D3	D:1201-1269,D:1331-1502
Q8RQE8	n/a	ZN	5vo8	e5vo8D8	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	5voi	e5voiD10	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	5x21	e5x21D1	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	5x22	e5x22N3	N:3-165,N:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	5xj0	e5xj0D7	D:1201-1269,D:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	5xj0	e5xj0D8	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	6asg	e6asgD5	D:3-165,D:449-610
Q8RQE8	n/a	ZN	6kqd	e6kqdD9	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	6kqd	e6kqdN10	N:3-165,N:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	6kqe	e6kqeD8	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	6kqf	e6kqfD12	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	6kqg	e6kqgD10	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	6kqh	e6kqhD5	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	6kql	e6kqlD3	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	6kqm	e6kqmD8	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	6kqn	e6kqnD1	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	6l74	e6l74D9	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	6lts	e6ltsD4	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	6m6a	e6m6aD7	D:3-165,D:449-622
Q8RQE8	n/a	ZN	6m6b	e6m6bD3	D:3-165,D:449-622
Q8RQE8	n/a	ZN	6m6c	e6m6cD5	D:3-165,D:449-622
Q8RQE8	n/a	ZN	6ovr	e6ovrD12	D:1201-1269,D:1331-1502
Q8RQE8	n/a	ZN	6ovr	e6ovrD9	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	6ovy	e6ovyD7	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	6ovy	e6ovyD9	D:1201-1269,D:1331-1502
Q8RQE8	n/a	ZN	6ow3	e6ow3D12	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	6ow3	e6ow3D4	D:1201-1269,D:1331-1502
Q8RQE8	n/a	ZN	6oy5	e6oy5D11	D:1201-1269,D:1331-1502
Q8RQE8	n/a	ZN	6oy5	e6oy5D7	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	6oy6	e6oy6D12	D:1201-1269,D:1331-1502
Q8RQE8	n/a	ZN	6oy6	e6oy6D8	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	6oy7	e6oy7D10	D:1201-1269,D:1331-1502
Q8RQE8	n/a	ZN	6oy7	e6oy7D7	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	6p70	e6p70D4	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	6p71	e6p71D9	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	6wox	e6woxD7	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	6wox	e6woxD9	D:1201-1269,D:1331-1502
Q8RQE8	n/a	ZN	6woy	e6woyD12	D:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	6woy	e6woyD5	D:1201-1269,D:1331-1502
Q8RQE8	n/a	ZN	7eh0	e7eh0D10	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	7eh1	e7eh1D5	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	7eh2	e7eh2D12	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	7eh2	e7eh2N12	N:3-165,N:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	7mlb	e7mlbD8	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	7mli	e7mliD1	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	7mlj	e7mljD1	D:3-165,D:449-609
Q8RQE8	n/a	ZN	7rdq	e7rdqD1	D:3-165,D:449-610
Q8RQE8	n/a	ZN	8hsg	e8hsgJ1	J:1201-1269,J:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	8hsg	e8hsgJ9	J:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	8hsh	e8hshJ8	J:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	8hsh	e8hshJ9	J:1201-1269,J:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	8hsl	e8hslJ1	J:1201-1269,J:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	8hsl	e8hslJ3	J:949-1109
Q8RQE8	n/a	ZN	8hsl	e8hslJ8	J:1110-1200
Q8RQE8	n/a	ZN	8hsr	e8hsrJ10	J:1201-1269,J:1331-1505
Q8RQE8	n/a	ZN	8hsr	e8hsrJ4	J:1110-1200